Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms