Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SUSD3Q96L08 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms