Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PHACTR3Q96KR7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms