Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLPTM1LQ96KA5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPTM1LQ96KA5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms