Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPNQ96H22 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms