Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms