Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CMTM5Q96DZ9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM5Q96DZ9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms