Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms