Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHISA4Q96DD7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms