Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms