Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN5

LRRC45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC45Q96CN5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC45Q96CN5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LRRC45Q96CN5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms