Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VOPP1Q96AW1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms