Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2E3Q969T4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms