Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCE1Q969G3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCE1Q969G3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms