Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms