Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC4Q92889 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC4Q92889 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms