Protein–RNA interactions for Protein: Q92565

RAPGEF5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF5Q92565 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAPGEF5Q92565 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF5Q92565 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms