Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CSRNP3Q8WYN3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms