Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI8

CLEC4D, C-type lectin domain family 4 member D, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4DQ8WXI8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLEC4DQ8WXI8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC4DQ8WXI8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms