Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASKIN2Q8WXE0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASKIN2Q8WXE0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASKIN2Q8WXE0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASKIN2Q8WXE0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASKIN2Q8WXE0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASKIN2Q8WXE0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CASKIN2Q8WXE0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASKIN2Q8WXE0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CASKIN2Q8WXE0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASKIN2Q8WXE0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASKIN2Q8WXE0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASKIN2Q8WXE0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms