Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF31Q8WWY3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF31Q8WWY3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms