Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms