Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC12Q8WUD4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC12Q8WUD4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms