Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2AF1L4Q8WU68 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms