Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms