Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY5

CREB3L4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L4Q8TEY5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L4Q8TEY5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3L4Q8TEY5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L4Q8TEY5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L4Q8TEY5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L4Q8TEY5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L4Q8TEY5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L4Q8TEY5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L4Q8TEY5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L4Q8TEY5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L4Q8TEY5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L4Q8TEY5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L4Q8TEY5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms