Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3RF2Q8TEC5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3RF2Q8TEC5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms