Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC43.48■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC43.46■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC43.46■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC43.45■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC43.44■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC43.43■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC43.42■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC43.41■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.38■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC43.38■■■■■ 4.54
RB1CC1Q8TDY2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC43.35■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC43.34■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC43.33■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC43.33■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC43.32■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
RB1CC1Q8TDY2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC43.32■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC43.31■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms