Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPBAR1Q8TDU6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GPBAR1Q8TDU6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPBAR1Q8TDU6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPBAR1Q8TDU6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPBAR1Q8TDU6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GPBAR1Q8TDU6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPBAR1Q8TDU6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPBAR1Q8TDU6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPBAR1Q8TDU6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPBAR1Q8TDU6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPBAR1Q8TDU6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPBAR1Q8TDU6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPBAR1Q8TDU6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPBAR1Q8TDU6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPBAR1Q8TDU6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPBAR1Q8TDU6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPBAR1Q8TDU6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPBAR1Q8TDU6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPBAR1Q8TDU6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GPBAR1Q8TDU6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPBAR1Q8TDU6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms