Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP61Q8NHU2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms