Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms