Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms