Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT1Q8NF37 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms