Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA4Q8NEY3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms