Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARMIL3Q8ND23 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms