Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LINC00116Q8NCU8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LINC00116Q8NCU8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms