Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPC24Q8NBT2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms