Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms