Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms