Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms