Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8AQ8IWT6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC8AQ8IWT6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms