Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI8

CRLF3, Cytokine receptor-like factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLF3Q8IUI8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms