Protein–RNA interactions for Protein: Q86XE0

SNX32, Sorting nexin-32, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX32Q86XE0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX32Q86XE0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX32Q86XE0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX32Q86XE0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX32Q86XE0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX32Q86XE0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX32Q86XE0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms