Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
N4BP2Q86UW6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
N4BP2Q86UW6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.7 ms