Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms