Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms