Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NANOGNBQ7Z5D8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NANOGNBQ7Z5D8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NANOGNBQ7Z5D8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NANOGNBQ7Z5D8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NANOGNBQ7Z5D8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms