Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4F1

LRP10, Low-density lipoprotein receptor-related protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP10Q7Z4F1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRP10Q7Z4F1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRP10Q7Z4F1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRP10Q7Z4F1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRP10Q7Z4F1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRP10Q7Z4F1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRP10Q7Z4F1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRP10Q7Z4F1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRP10Q7Z4F1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRP10Q7Z4F1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms