Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APTXQ7Z2E3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
APTXQ7Z2E3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms