Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HS2ST1Q7LGA3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms